RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 FAM50BQ9Y247 325 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 A0A1B0GVL5 298 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 MBTPS2O43462 519 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 FAM189A1O60320 539 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 LILRB3O75022 631 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CLCNKBP51801 687 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 DSG1Q02413 1049 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KCNA1Q09470 495 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CASP10Q92851 521 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 B3GALT6Q96L58 329 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CHST7Q9NS84 486 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.61■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 B3GAT3O94766 335 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 AFMP43652 599 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 UPP1Q16831 310 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 HPSEQ9Y251 543 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.6■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 VCANP13611 3396 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TTC26A0AVF1 554 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SLFN14P0C7P3 912 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KLRC2P26717 231 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CASP1P29466 404 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 HPS3Q969F9 1004 aa22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PODXLO00592 558 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 EPCAMP16422 314 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SPAG1Q07617 926 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 POSTNQ15063 836 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 UNC13DQ70J99 1090 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KIF12Q96FN5 646 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TMEM206Q9H813 350 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 USP25Q9UHP3 1055 aa22.58■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PQ27 194 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PQ64 194 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PQD8 194 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 LACTBL1A8MY62 500 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 TEX28O15482 410 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 ADH1AP07327 375 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 ADSSP30520 456 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 ACOT2P49753 483 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 CUL4BQ13620 913 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 RTP2Q5QGT7 225 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 CEP57Q86XR8 500 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 GPR65Q8IYL9 337 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 FAM212AQ96EL1 285 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 TTPALQ9BTX7 342 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.57■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 ADRB2P07550 413 aa22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 SYKP43405 635 aa22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 CLCN4P51793 760 aa22.56■■□□□ 1.2
VARS-218ENST00000459667 NDUFA8P51970 172 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms