RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 BRCC3P46736 316 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 GTF2BQ00403 316 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 DHX58Q96C10 678 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 RXFP1Q9HBX9 757 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.1■■□□□ 1.77
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM189A1O60320 539 aa26.07■■□□□ 1.76
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SH3BP5-208ENST00000459627 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 FNIP2Q9P278 1114 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 FGFR3P22607 806 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP2R3AQ06190 1150 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 RESP18Q5W5W9 173 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 ADALQ6DHV7 355 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
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