RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 RTL10Q7L3V2 364 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 CEP120Q8N960 986 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 PNMA5Q96PV4 448 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 PLIN2Q99541 437 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.6■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 C8AP07357 584 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 LAMP2P13473 410 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 KCNE1P15382 129 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 SCP2P22307 547 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 PROZP22891 400 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 OR1D2P34982 312 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 CLCN5P51795 746 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 TCF15Q12870 199 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 RAB33AQ14088 237 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZPBP2Q6X784 338 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 BRAPQ7Z569 592 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 SNX27Q96L92 541 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 MTRRQ9UBK8 725 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-206ENST00000431413 CLDN3O15551 220 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 PDCP20941 246 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 FSHRP23945 695 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SLC12A3P55017 1021 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 FLCNQ8NFG4 579 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 BICD1Q96G01 975 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 MYADMQ96S97 322 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 CNTN3Q9P232 1028 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 WNT16Q9UBV4 365 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 POLIQ9UNA4 740 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 PLXNA3P51805 1871 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 PODXLO00592 558 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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HERC3-206ENST00000431413 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 KYAT1Q16773 422 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 H7C4K7 107 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ABLIM1O14639 778 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SYN3O14994 580 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 POU2F2P09086 479 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SRFP11831 508 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ELF1P32519 619 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ABCD1P33897 745 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 BRCC3P46736 316 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 GPBP1Q86WP2 473 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 SIX5Q8N196 739 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 H0Y858 1186 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 I3L4J1 428 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 STK25O00506 426 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 CCL16O15467 120 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 ADAM12O43184 909 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 FAM13AO94988 1023 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 CFHP08603 1231 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 CLTAP09496 248 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 AOC1P19801 751 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 LIG4P49917 911 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 NCKAP1LP55160 1127 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 MCL1Q07820 350 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-206ENST00000431413 MYCT1Q8N699 235 aa16.55■□□□□ 0.24
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