RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 NPR3P17342 541 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 AOC1P19801 751 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 GJB2P29033 226 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 UVSSAQ2YD98 709 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 KCNN1Q92952 543 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SNX27Q96L92 541 aa23.01■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CITO14578 2027 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A4O43511 780 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SRFP11831 508 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 KCNE1P15382 129 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1LQ5SGD2 360 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ANKS3Q6ZW76 656 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 RSAD2Q8WXG1 361 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA5Q96PV4 448 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 RTP3Q9BQQ7 232 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CNTN3Q9P232 1028 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL21Q9UKT6 434 aa23■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA1HO95180 2353 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PROB1E7EW31 1015 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 H3BQV1 296 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM12O43184 909 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 TOM1L1O75674 476 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PLS3P13797 630 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 FSHRP23945 695 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC12A3P55017 1021 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 HTR4Q13639 388 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SIX5Q8N196 739 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 FLCNQ8NFG4 579 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 AK8Q96MA6 479 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ACAP3Q96P50 834 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 MYH11P35749 1972 aa22.99■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 H0Y858 1186 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A4O15374 487 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 XYLBO75191 536 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 OR1D2P34982 312 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SMTNP53814 917 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 STRN3Q13033 797 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ZPBP2Q6X784 338 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.98■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 TCHPQ9BT92 498 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CDH7Q9ULB5 785 aa22.97■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SFI1A8K8P3 1242 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 H0YCG3 227 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PODXLO00592 558 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SYN3O14994 580 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G4BP0C869 781 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 SCP2P22307 547 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 NBL1P41271 181 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 OSTNP61366 133 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.96■■□□□ 1.27
LIMS1-208ENST00000428064 KRBA1A5PL33 1030 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 CFHP08603 1231 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 BRCC3P46736 316 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 MCL1Q07820 350 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 CCL16O15467 120 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D4O60343 1298 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 GFRA3O60609 400 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 BMP15O95972 392 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 NCKAP1LP55160 1127 aa22.94■■□□□ 1.26
LIMS1-208ENST00000428064 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.94■■□□□ 1.26
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