RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACEP12821 1306 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 LTN1O94822 1766 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 JCADQ9P266 1359 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ABCC6O95255 1503 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A1W2PRX2 142 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 C2orf78A6NCI8 922 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 FIBPO43427 364 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 KCNQ2O43526 872 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 AK2P54819 239 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAP3K12Q12852 859 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CRHR2Q13324 411 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TUBA3CQ13748 450 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRT32Q14532 448 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRT24Q2M2I5 525 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SARM1Q6SZW1 724 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 RUFY3Q7L099 469 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 G2E3Q7L622 706 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 EVI5LQ96CN4 794 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRIM8Q9BZR9 551 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 NELFAQ9H3P2 528 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MTMR6Q9Y217 621 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPEF2Q9C093 1822 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 GJB2P29033 226 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MCM7P33993 719 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 AMPHP49418 695 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 GSDMDP57764 484 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TGFB2P61812 414 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 HHEXQ03014 270 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 GAREM2Q75VX8 874 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CHST14Q8NCH0 376 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 DNAAF4Q8WXU2 420 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 RABGGTAQ92696 567 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MKL1Q969V6 931 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CHFRQ96EP1 664 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 GPHA2Q96T91 129 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TNMDQ9H2S6 317 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 OGFRQ9NZT2 677 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CEP72Q9P209 647 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CFAP45Q9UL16 551 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 COL15A1P39059 1388 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 MED23Q9ULK4 1368 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLIT3O75094 1523 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRAF5O00463 557 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 UTYO14607 1347 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 PLD2O14939 933 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCP110O43303 1012 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 OPA1O60313 960 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-954P-201ENST00000411355 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms