RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.36□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 25
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PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K14Q99558 947 aa9.36□□□□□ -0.91
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PTPRM-202ENST00000400053 TMEM120BA0PK00 339 aa9.36□□□□□ -0.91
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PTPRM-202ENST00000400053 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.36□□□□□ -0.91
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PTPRM-202ENST00000400053 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRM-202ENST00000400053 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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PTPRM-202ENST00000400053 THTPAQ9BU02 230 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-202ENST00000400053 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
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