RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 KANK3Q6NY19 840 aa22.49■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.49■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 TTPALQ9BTX7 342 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.49■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.194e-7■■■■□ 26.5
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UBE2E3-201ENST00000392415 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.48■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 CUTAO60888 179 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 KYAT1Q16773 422 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR149Q86SP6 731 aa22.47■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 PDILTQ8N807 584 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.47■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 TTC26A0AVF1 554 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 OGTO15294 1046 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM189A1O60320 539 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR37L1O60883 481 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R37O75864 691 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 WEE2P0C1S8 567 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 GAP43P17677 238 aa22.46■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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UBE2E3-201ENST00000392415 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 TGM5O43548 720 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAPPC3O43617 180 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL8P10145 99 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 E2F4Q16254 413 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD5Q16401 504 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 SHC4Q6S5L8 630 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 PALB2Q86YC2 1186 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 HVCN1Q96D96 273 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 NR2E1Q9Y466 385 aa22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 PODXLO00592 558 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 PAPLNO95428 1278 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 ADRB2P07550 413 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFSF9P41273 254 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.44■■□□□ 1.18
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UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP45Q9UL16 551 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO10Q9HD67 2058 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31D3P0C874 917 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 BRCC3P46736 316 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB6Q15916 424 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.43■■□□□ 1.18
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