RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 HSPA6P17066 643 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 FGFR4P22455 802 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 LMNB2Q03252 620 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CUL2Q13617 745 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 C2CD6Q53TS8 623 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MED4Q9NPJ6 270 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.68□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 EBAG9O00559 213 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087WZ62 844 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFAB1O14561 156 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ATP8B1O43520 1251 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 SLCO1A2P46721 670 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RGS7P49802 495 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 FCGRTP55899 365 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 VSNL1P62760 191 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GLRA4Q5JXX5 417 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CEP57Q86XR8 500 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 BBOF1Q8ND07 529 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MCEEQ96PE7 176 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 SETD4Q9NVD3 440 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 C10orf71Q711Q0 1435 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC188H7C350 402 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 INSRRP14616 1297 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GARTP22102 1010 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ADCY1Q08828 1119 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GNASQ5JWF2 1037 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 FMO2Q99518 471 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 TJP3O95049 919 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 PDGFRBP09619 1106 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 TGFB3P10600 412 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RARBP10826 455 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RBP5P82980 135 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ITKQ08881 620 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CCNYQ8ND76 341 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 TATDN2Q93075 761 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.67□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 EPHB6O15197 1021 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GBP1P32455 592 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 UBA3Q8TBC4 463 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 KCTD10Q9H3F6 313 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 NAGPAQ9UK23 515 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM253P0C7T8 217 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CDK17Q00537 523 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CUL1Q13616 776 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 AMHR2Q16671 573 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 SLC35C1Q96A29 364 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 AMACRQ9UHK6 382 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ANXA13P27216 316 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 PHBP35232 272 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CGRRF1Q99675 332 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 PLAAQ9Y263 795 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 WHAMMQ8TF30 809 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 CAPS2Q9BXY5 557 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ATP8B3O60423 1300 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 RPS6KA5O75582 802 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 STAG3L1P0CL83 205 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 ARL4AP40617 200 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-202ENST00000372904 KCNMA1Q12791 1236 aa10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms