RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 TMC2Q8TDI7 906 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT6BQ92526 530 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM84AQ96KN4 292 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MTFR1LQ9H019 292 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SCTRP47872 440 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PRELID2Q8N945 189 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GZMAP12544 262 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CHN1P15882 459 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SV2AQ7L0J3 742 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB20Q9NX57 234 aa25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RTP1P59025 263 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ADCY2Q08462 1091 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 AADACL2Q6P093 401 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GPD1LQ8N335 351 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT35Q92764 455 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CDHR1Q96JP9 859 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 AGTP01019 485 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP11B1P15538 503 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MARCKSL1P49006 195 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC29A2Q14542 456 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 FUKQ8N0W3 1084 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MORC4Q8TE76 937 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GGA3Q9NZ52 723 aa25.56■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 FSTL1Q12841 308 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CYB5D1Q6P9G0 228 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC197Q8NCU1 140 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SGSM3Q96HU1 749 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 NT5C1BQ96P26 610 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CD248Q9HCU0 757 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ASAP2O43150 1006 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP4AP20648 1035 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GNPTABQ3T906 1256 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MTERF2Q49AM1 385 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 AZI2Q9H6S1 392 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa25.55■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 TLDC2A0PJX2 215 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 STAM2O75886 525 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GARTP22102 1010 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2H1P32780 548 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PEX5P50542 639 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 XRCC4Q13426 336 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKS4BQ8N8V4 417 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR90Q96KV7 1748 aa25.54■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PEX10O60683 326 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MTA2O94776 668 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKG1Q13976 671 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SLMAPQ14BN4 828 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC27Q6P3X3 843 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 BICD1Q96G01 975 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPC6Q9Y210 931 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 COMTP21964 271 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CDR2Q01850 454 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MESDQ14696 234 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 SNCBQ16143 134 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP1B1Q16678 543 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 XKR3Q5GH77 459 aa25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms