RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOMM20Q15388 145 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPM1JQ5JR12 505 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM35AQ86V20 835 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNIP3Q96KP6 325 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRB3Q9BUF7 120 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYH6P13533 1939 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPTLC2O15270 562 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHOBTB3O94955 611 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAT2P11245 290 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD247P20963 164 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COG2Q14746 738 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPECC1Q5M775 1068 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP53Q70EK8 1073 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBCKQ8TEA7 893 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBC1D5Q92609 795 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPP4Q96JB8 637 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCHHQ07283 1943 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCAND1P57086 179 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNAPC2Q13487 334 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC32Q14392 662 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTC38Q5R3I4 469 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CST9Q5W186 159 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLIC6Q96NY7 704 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PANK2Q9BZ23 570 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKS1Q9NXB0 559 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCN4AP35499 1836 aa7.09□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VWA5AO00534 786 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLEC3AO75596 197 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR20EP86478 221 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR20CP86479 221 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR20DP86480 221 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR20BP86481 221 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR20AP86496 221 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LAMC2Q13753 1193 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPY5RQ15761 445 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DIO2Q92813 273 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SKA1Q96BD8 255 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SGCZQ96LD1 299 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 JADE2Q9NQC1 790 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VGLL3A8MV65 326 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP2C8P10632 490 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNFAIP3P21580 790 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNJ6P48051 423 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBE2HP62256 183 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GUCY1A3Q02108 690 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPIL2Q13356 520 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIRC3Q13489 604 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMK4Q16566 473 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCL15Q16663 113 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALNT17Q6IS24 598 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.08□□□□□ -1.28
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