RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 CFAP69A5D8W1 941 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 EXOC3O60645 756 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 TCEA3O75764 348 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 SGPL1O95470 568 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 CA4P22748 312 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 BTDP43251 543 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 KCTD1Q719H9 257 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 TRABD2AQ86V40 505 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.1■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 MAGEB2O15479 319 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ECE2O60344 883 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PYGBP11216 843 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 C8orf37Q96NL8 207 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 SLC5A5Q92911 643 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF653Q96CK0 615 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 GSTA2P09210 222 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 NEK3P51956 506 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PDK4Q16654 411 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 RASIP1Q5U651 963 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 BICD1Q96G01 975 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 EURLQ9NYK6 297 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 FAM13AO94988 1023 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PSMG1O95456 288 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 NT5C2P49902 561 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 DLG4P78352 724 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 OCRLQ01968 901 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 SLC34A1Q06495 639 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PTK6Q13882 451 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 STAT4Q14765 748 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 HHATQ5VTY9 493 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 ANO3Q9BYT9 981 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 TLE6Q9H808 572 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPF39-201ENST00000355765 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ZBTB39O15060 712 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 GATA6Q92908 595 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.08■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 FSCN2O14926 492 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ETS2P15036 469 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 RPA1P27694 616 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 GCAP28676 217 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ITPK1Q13572 414 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ERMNQ8TAM6 284 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 TIPINQ9BVW5 301 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 A0A0G2JND7 137 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 GAS8O95995 478 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 POTEJP0CG39 1038 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 STMN2Q93045 179 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1W2PPM1 405 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 GYG2O15488 501 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 GSC2O15499 205 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 BCRP11274 1271 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 AKR1B1P15121 316 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 SMC6Q96SB8 1091 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 NDNQ99608 321 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.06■□□□□ 0.8
PRPF39-201ENST00000355765 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms