RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SENP1Q9P0U3 644 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ZFATQ9P243 1243 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 LAMC1P11047 1609 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC3O43617 180 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 IL31Q6EBC2 164 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 CHGBP05060 677 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 RBP5P82980 135 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 EMC2Q15006 297 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ADCK2Q7Z695 626 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MFN1Q8IWA4 741 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 GH1P01241 217 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 DAB2P98082 770 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NCOA4Q13772 614 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR2P61160 394 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SNAPC2Q13487 334 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 KIZQ2M2Z5 673 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 P3H1Q32P28 736 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH1A1P00352 501 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ERFP50548 548 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 XKR3Q5GH77 459 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD14O00487 310 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PRRG1O14668 218 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PDGFRAP16234 1089 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 AKT1P31749 480 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2H3Q13889 308 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 DPF2Q92785 391 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 HACL1Q9UJ83 578 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 GGA3Q9NZ52 723 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PFASO15067 1338 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ST8SIA6P61647 398 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SPDYE7PQ495Y7 208 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP14Q86W24 1093 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 GGT7Q9UJ14 662 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 BLVRAP53004 296 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 DEUP1Q05D60 604 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RAB42Q8N4Z0 105 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MTBPQ96DY7 904 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6KA5O75582 802 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MTA3Q9BTC8 594 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 DGAT1O75907 488 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RUBCNLQ9H714 662 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5HO75947 161 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 APRTP07741 180 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF197O14709 1029 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.55■■□□□ 1.36
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PTPRM-201ENST00000332175 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM21Q9UKJ8 722 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PRKCEQ02156 737 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PDIA5Q14554 519 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RRM2BQ7LG56 351 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2R1Q13018 1463 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 HMOX2P30519 316 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP10A1A4S6 786 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA4P13612 1032 aa23.55■■□□□ 1.36
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