RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 PIM2Q9P1W9 311 aa20.56■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.56■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.56■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 USTQ9Y2C2 406 aa20.56■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 H0YHG0 523 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PMM2O15305 246 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 DGAT1O75907 488 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PIK3CAP42336 1068 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 KRT17Q04695 432 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 TLCD1Q96CP7 247 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MTFR1LQ9H019 292 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 HLA-DRAP01903 254 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PTPRAP18433 802 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CHKAP35790 457 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 IFNAR2P48551 515 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 TCEAL1Q15170 157 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 LONRF1Q17RB8 773 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 TMEM270Q6UE05 265 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 DLK2Q6UY11 383 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 HOOK3Q86VS8 718 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 GPRASP2Q96D09 838 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC114Q96M63 670 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PICK1Q9NRD5 415 aa20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 HSPA6P17066 643 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 RIPK2O43353 540 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 NUDT17P0C025 328 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ATP4AP20648 1035 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CNTN2Q02246 1040 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 EMC2Q15006 297 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MYPNQ86TC9 1320 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PASKQ96RG2 1323 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 NFKBIEO00221 500 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 EDN1P05305 212 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 WDR44Q5JSH3 913 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 USP37Q86T82 979 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 REPS2Q8NFH8 660 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 TP73O15350 636 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 DSG3P32926 999 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CALCOCO2Q13137 446 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CLUL1Q15846 466 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MGARPQ8TDB4 240 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ART4Q93070 314 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CABS1Q96KC9 395 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 FBXO40Q9UH90 709 aa20.53■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 VNN1O95497 513 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 GCNT1Q02742 428 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.52■□□□□ 0.88
NHLH2-201ENST00000320238 GGPS1O95749 300 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 CREB1P16220 341 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 CD58P19256 250 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 STRN3Q13033 797 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 LRRC14Q15048 493 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 CYP1B1Q16678 543 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF394Q53GI3 561 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.52■□□□□ 0.87
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms