RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 PLS3P13797 630 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 CYP3A7P24462 503 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 PRKCIP41743 596 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SKOR1P84550 965 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 VCPKMTQ9H867 229 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 F8VZ95 297 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 GFAPP14136 432 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 CIITAP33076 1130 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 COPB2P35606 906 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MARSP56192 900 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 DEUP1Q05D60 604 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 TBCCQ15814 346 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 KAZNQ674X7 775 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 BTNL10A8MVZ5 291 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 FANCGO15287 622 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SEC24CP53992 1094 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MYO1EQ12965 1108 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MYBPC2Q14324 1141 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 A6NJR5 290 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 ADAMTS3O15072 1205 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 CYP26A1O43174 497 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 STAM2O75886 525 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SNHG28P0DPA3 235 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MYBL1P10243 752 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 CYP4F22Q6NT55 531 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 GANQ9H2C0 597 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MYH7P12883 1935 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 BNIP3LO60238 219 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 EFCAB14O75071 495 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 URGCPQ8TCY9 931 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MKL1Q969V6 931 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SCYL1Q96KG9 808 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 WRNIP1Q96S55 665 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 ADAM22Q9P0K1 906 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 LAMA4Q16363 1823 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 YWHABP31946 246 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 SESN3P58005 492 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF720Q7Z2F6 126 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 TCP11Q8WWU5 503 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 CYFIP2Q96F07 1278 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1B0GW55 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4L2P0CJ85 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4L3P0CJ86 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4L4P0CJ87 422 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4L5P0CJ88 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4L6P0CJ89 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4L7P0CJ90 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PCYT1AP49585 367 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KSR1Q8IVT5 923 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MREGQ8N565 214 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL29Q96CT2 875 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SAAL1Q96ER3 474 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DUX4Q9UBX2 424 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SCOCQ9UIL1 159 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 PRPSAP1Q14558 356 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 THAP2Q9H0W7 228 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 KRT1P04264 644 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FAM153BP0C7A2 387 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FDX1P10109 184 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 OCA2Q04671 838 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FAM153CQ494X1 144 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 MTERF2Q49AM1 385 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRG-201ENST00000295874 FAM151AQ8WW52 585 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms