RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 GRK7Q8WTQ7 553 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 POMGNT1Q8WZA1 660 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 CCT8L1PA6NM43 557 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 UNGP13051 313 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 KRT5P13647 590 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 CAV1Q03135 178 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SPRED3Q2MJR0 410 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 CCDC25Q86WR0 208 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 GPD1LQ8N335 351 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SERPINB12Q96P63 405 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 KIFC3Q9BVG8 833 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 PXMP2Q9NR77 195 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 HOMER3Q9NSC5 361 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SAMD15Q9P1V8 674 aa29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 GARTP22102 1010 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 ATP5DP30049 168 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 PTK6Q13882 451 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 RHBDF2Q6PJF5 856 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SNF8Q96H20 258 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 RMDN3Q96TC7 470 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.9■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 SLCO1A2P46721 670 aa29.89■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 XRCC4Q13426 336 aa29.89■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 MCOLN2Q8IZK6 566 aa29.89■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
UBP1-201ENST00000283628 TP73O15350 636 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 SCP2P22307 547 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CNGA2Q16280 664 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CCDC50Q8IVM0 306 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 LRRC34Q8IZ02 419 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 C1orf54Q8WWF1 131 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 AAASQ9NRG9 546 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 ASIC3Q9UHC3 531 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa29.89■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 ARID2Q68CP9 1835 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CHUKO15111 745 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 GAS8O95995 478 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 RTP1P59025 263 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 PTP4A2Q12974 167 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 BSNDQ8WZ55 320 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 TEPSINQ96N21 525 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 WDR81Q562E7 1941 aa29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 GSTA1P08263 222 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 ABCD1P33897 745 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 BPIFB4P59827 614 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 FUKQ8N0W3 1084 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 SGSM3Q96HU1 749 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 EGFRP00533 1210 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 TNFAIP1Q13829 316 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.372e-6■■■□□ 15.4
UBP1-201ENST00000283628 EXOC3L1Q86VI1 746 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 MROH7Q68CQ1 1323 aa29.87■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CENPCQ03188 943 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CYB5D1Q6P9G0 228 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CEP170P1Q96L14 293 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 YY1AP1Q9H869 796 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 NLRX1Q86UT6 975 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V0A1Q93050 837 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 GPRASP2Q96D09 838 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 DCLK3Q9C098 648 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1586Q9HCI6 787 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 GINM1Q9NU53 330 aa29.86■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 MYPNQ86TC9 1320 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 H0YCG3 227 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 MAFGO15525 162 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 IVDP26440 423 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 SNX1Q13596 522 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 CHST7Q9NS84 486 aa29.85■■■□□ 2.37
UBP1-201ENST00000283628 ZBED4O75132 1171 aa29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms