RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 EGFRP00533 1210 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RCAN1P53805 252 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 GPS1Q13098 491 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PTPN21Q16825 1174 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HES6Q96HZ4 224 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RASA4BC9J798 803 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RASA4O43374 803 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 VCLP18206 1134 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CDC25BP30305 580 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RAP1GDS1P52306 607 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EMC2Q15006 297 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 KIZQ2M2Z5 673 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 VCPKMTQ9H867 229 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 IGFBP4P22692 258 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SLC11A2P49281 568 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SNCBQ16143 134 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SLC15A2Q16348 729 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MTA3Q9BTC8 594 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MAPKBP1O60336 1514 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 STK36Q9NRP7 1315 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TDP2O95551 362 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ODC1P11926 461 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EPHX2P34913 555 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 TP53BP2Q13625 1128 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TMC7Q7Z402 723 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RAD18Q9NS91 495 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZFATQ9P243 1243 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZW10O43264 779 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 DIAPH2O60879 1101 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CAND2O75155 1236 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFB10O96000 172 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CKMP06732 381 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NCALDP61601 193 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ANKS6Q68DC2 871 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 MAP3K10Q02779 954 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 COG1Q8WTW3 980 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 INTUQ9ULD6 942 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PALMO75781 387 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 APOA4P06727 396 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM49P0CI25 452 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM49CP0CI26 452 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 STARD3Q14849 445 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.11□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ADA2Q9NZK5 511 aa11.11□□□□□ -0.63
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