RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 MFSD5Q6N075 450 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 CEP89Q96ST8 783 aa22.18■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.17■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.17■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.17■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 CLDN10P78369 228 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.16■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.16■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.16■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 MYPNQ86TC9 1320 aa22.16■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 ASAP2O43150 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SLCO1A2P46721 670 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 SNX1Q13596 522 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CCDC114Q96M63 670 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.15■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CALCAP01258 141 aa22.15■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 KCNA3P22001 575 aa22.15■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.15■■□□□ 1.14
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STRADB-201ENST00000194530 LIG4P49917 911 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CAV1Q03135 178 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 PTP4A2Q12974 167 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 PTK6Q13882 451 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CDHR1Q96JP9 859 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.14■■□□□ 1.14
STRADB-201ENST00000194530 GAS8O95995 478 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 LLGL1Q15334 1064 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ZACNQ401N2 412 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SERPINB12Q96P63 405 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 DCLK3Q9C098 648 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CHST7Q9NS84 486 aa22.14■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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STRADB-201ENST00000194530 GHRP10912 638 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TNNI1P19237 187 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CENPCQ03188 943 aa22.13■■□□□ 1.13
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STRADB-201ENST00000194530 HLA-DRAP01903 254 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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