RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atp5hQ9DCX2 161 aa15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cxcl11Q9JHH5 100 aa15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Angptl2Q9R045 493 aa15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf667Q2TL60 609 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rhox12Q4TU81 186 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccdc169Q8BXX9 214 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 ClyblQ8R4N0 338 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ier5lQ99J55 406 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pdcd2P46718 343 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Bpifb5Q3UQ05 490 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kctd1Q5M956 257 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 CcnhQ61458 323 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nqo1Q64669 274 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 IgflQ6B9Z0 140 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr297Q7TS07 310 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 CrebzfQ91ZR3 358 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr247E9PVJ7 320 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr552E9Q545 317 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr819K7N727 320 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pias1O88907 651 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnf216P58283 853 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Runx2Q08775 607 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kctd21Q3URF8 260 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptk6Q64434 451 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 BC048507Q80ZS7 89 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Psmd5Q8BJY1 504 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gimap5Q8BWF2 308 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Stoml1Q8CI66 399 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rapgef3Q8VCC8 918 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Psmd9Q9CR00 222 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Snf8Q9CZ28 258 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cnot8Q9D8X5 292 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sec14l1A8Y5H7 715 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm8257E9Q8R3 264 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Il17cQ8K4C5 194 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cd300ldQ8VCH2 221 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 FtcdQ91XD4 541 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Usp26Q99MX1 835 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Serpini1O35684 410 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AdssP46664 456 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nsrp1Q5NCR9 542 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Xlr3aQ60595 226 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Capn11Q6J756 714 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfp120Q8BZW4 436 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf426Q8R1D1 550 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Klhl35Q9CZ49 574 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ubxn11Q9D572 484 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptpn12P35831 775 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Psmc6P62334 389 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trim75Q3UWZ0 467 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf583Q3V080 568 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fam71bQ5STT6 665 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cnot7Q60809 285 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Orai3Q6P8G8 290 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 GmipQ6PGG2 971 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Stk32aQ8BGW6 398 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pkn2Q8BWW9 983 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Phactr3Q8BYK5 558 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Unc5bQ8K1S3 945 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ssfa2Q922B9 1252 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mad2l2Q9D752 211 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rcan1Q9JHG6 198 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 RecqlQ9Z129 648 aa15.46■□□□□ 0.07
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfyve9A2A8R0 1397 aa15.46■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ano3A2AHL1 981 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Serpinb3cA2RSF9 386 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kbtbd2G3X9X1 623 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Thap3Q8BJ25 218 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ppm1fQ8CGA0 452 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kat5Q8CHK4 513 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr1502Q8VG66 316 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trmt112Q9DCG9 125 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dach1Q9QYB2 751 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Myh2G3UW82 1942 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tom1O88746 492 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 TxkP42682 527 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PcQ05920 1178 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 B3glctQ8BHT6 489 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ano4Q8C5H1 955 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pcdha3Q91Y16 942 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rfc4Q99J62 364 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp4f14Q9EP75 524 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dbn1Q9QXS6 706 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 RptorQ8K4Q0 1335 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rrm1P07742 792 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sstr1P30873 391 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arl1P61211 181 aa15.45■□□□□ 0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Inf2Q0GNC1 1273 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms