RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W PTC6P25646 442 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W AFG1P32317 509 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SOF1P33750 489 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W ZRT3P34240 503 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W COS9P36034 407 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W RCN1P36054 211 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SDS24P38314 527 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SSH1P38353 490 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YEL057CP39983 233 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W XBP1P40489 647 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W LOH1P47055 219 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W ADO1P47143 340 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YGL260WP53056 76 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W DOC1P53068 250 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YGL204CP53089 101 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SCW4P53334 386 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W ALG12P53730 551 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W AIM36Q03798 255 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YMR252CQ04814 134 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W COQ11Q05892 277 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W GAS2Q06135 555 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W MCH4Q08268 501 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SRL2Q12020 392 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W TMS1Q12116 473 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YRM1Q12340 786 aa4.29□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W OPI3P05375 206 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SPS4P09937 338 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W MATALPHA1P0CY06 175 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W HMLALPHA1P0CY07 175 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W CTA1P15202 515 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SPT14P32363 452 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SNC2P33328 115 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W FRM2P37261 193 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YHK8P38776 514 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W MIT1P40002 666 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W PHB1P40961 287 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W IRC18P47056 224 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W TPN1P53099 579 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W YNR048WP53740 393 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W ASI3P53983 676 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W HLR1Q04429 423 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W TPO3Q06451 622 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W SSK1Q07084 712 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W RCN2Q12044 265 aa4.28□□□□□ -1.72
TRM10YOL093W IPP1P00817 287 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W HIS3P06633 220 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W DSF1P0CX08 502 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W YNR073CP0CX09 502 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W GCN3P14741 305 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W CNE1P27825 502 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W PPZ2P33329 710 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W MRPL3P36516 390 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W APL3P38065 1025 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W YBR242WP38331 238 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W HTD2P38790 280 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W HPA3P39979 161 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W PUG1P40100 303 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W YIL169CP40442 995 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W SYS1P41544 203 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W IDP2P41939 412 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W UBX6P47049 396 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W AIM25P47140 327 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W YJR120WP47157 116 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W GLO1P50107 326 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W MRH4P53166 561 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W ERV29P53337 310 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W LSM7P53905 115 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W RAF1Q06891 181 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W ATG41Q12048 136 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W USB1Q12208 290 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W IZH2Q12442 317 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa4.27□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data4.26□□□□□ -1.73not detected
TRM10YOL093W MES1P00958 751 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W ADH7P25377 361 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W PCL2P25693 308 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W RFA3P26755 122 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W RIB7P33312 244 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W CLG1P35190 452 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W YMR262WP38430 313 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W LSM1P47017 172 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W LYS20P48570 428 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W COX18P53239 316 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W VHT1P53241 593 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W PCP1P53259 346 aa4.26□□□□□ -1.73
TRM10YOL093W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data4.26□□□□□ -1.73not detected
TRM10YOL093W MRP51Q02950 344 aa4.26□□□□□ -1.73
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