RNA–Protein interactions for RNA: YOL078W

AVO1, Transcript of Component of a membrane-bound complex containing the Tor2p kinase, yeast

Gene AVO1, Length 3,531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO1	YOL078W	RMD6	P39975	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YFH7	P43591	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SDC1	Q03323	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ATG15	P25641	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	PHA2	P32452	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SFK1	P35735	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SPC34	P36131	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SEN34	P39707	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YGL034C	P53186	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SUR7	P54003	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	MSA1	Q08471	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ERP3	Q12403	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ERD2	P18414	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	FUN26	P31381	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ZRT1	P32804	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ECM14	P38836	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YFL064C	P43540	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	GUF1	P46943	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	STP1	Q00947	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	DYN3	Q04949	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	POM33	Q12164	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YCR007C	P25354	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	CSG2	P35206	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RCK1	P38622	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	WSC4	P38739	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	COX15	P40086	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	AIM23	P47015	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	PEX30	Q06169	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	THI72	Q08579	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	HMS2	P47175	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RPB8	P20436	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	COQ5	P49017	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YPS5	P53057	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YCR006C	P25350	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SOL4	P53315	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	BBP1	Q12365	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	ICT1	Q12385	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YCR022C	P25620	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	HPF1	Q05164	967 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	DAS2	Q12084	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	KIN28	P06242	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	HIS3	P06633	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RBG1	P39729	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	KRE29	P40026	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SWC4	P53201	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YMD8	Q03697	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	MIM1	Q08176	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	FRE8	Q12209	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	MCT1	Q12283	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	PDC2	P32896	925 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	APL3	P38065	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SDS24	P38314	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	TPC1	P53257	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	CTR3	Q06686	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	HRD1	Q08109	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	THI20	Q08224	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	TIR2	P33890	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	PHD1	P36093	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
AVO1	YOL078W	ATP23	P53722	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	NCA2	Q12374	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	PPH21	P23594	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	CBP4	P37267	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YJR012C	P47087	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	LDB18	Q07887	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	HSP30	P25619	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	CUE1	P38428	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	LAG1	P38703	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	DOG1	P38774	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	HEM14	P40012	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	SOL1	P50278	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YNL184C	P53876	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVO1	YOL078W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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