RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	PSMC6	P62333	389 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FYB2	Q5VWT5	728 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		15.25	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	HBP1	O60381	514 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	VPS52	Q8N1B4	723 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	P3H4	Q92791	437 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM161B	Q96MY7	647 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	VTA1	Q9NP79	307 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLK14	Q9P0G3	267 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	GRAP2	O75791	330 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	GJB1	P08034	283 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMARCA1	P28370	1054 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	NME3	Q13232	169 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	IKBKE	Q14164	716 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	AMH	P03971	560 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	UCHL3	P15374	230 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PHB	P35232	272 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	RPAIN	Q86UA6	219 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	WDR24	Q96S15	920 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		15.24	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997		H3BRB1	525 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997		I3L4J1	428 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	INHBA	P08476	426 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR1G1	P47890	313 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FMO5	P49326	533 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	NCOA4	Q13772	614 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SEPT6	Q14141	434 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	C2CD2L	O14523	706 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03	4e-10	■■□□□ 14.5
NEDD4L-238	ENST00000635997	IRX4	P78413	519 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZBTB39	O15060	712 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SDC4	P31431	198 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	DR1	Q01658	176 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	TREML2	Q5T2D2	321 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03	5e-6	■□□□□ 8.4
NEDD4L-238	ENST00000635997	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM50B	Q9Y247	325 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	MAFG	O15525	162 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	C2CD6	Q53TS8	623 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	GMCL1	Q96IK5	515 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		15.23	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	NFAT5	O94916	1531 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	LCP1	P13796	627 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	15.22	■□□□□ 0.03	2e-7	■■■■□ 22.9
NEDD4L-238	ENST00000635997	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	HOXA2	O43364	376 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SOX5	P35711	763 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	TSPY1	Q01534	308 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	RAPH1	Q70E73	1250 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PBK	Q96KB5	322 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRRG1	O14668	218 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	MTM1	Q13496	603 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		15.22	■□□□□ 0.03
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDXDC1	Q6P996	788 aa		15.22	■□□□□ 0.03

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