RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 XKR4Q5GH76 650 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM199Q8N511 208 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 SNX27Q96L92 541 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 ACAP3Q96P50 834 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 VPS16Q9H269 839 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 IL23AQ9NPF7 189 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 TTC3P53804 2025 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 ENPEPQ07075 957 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 MAN2A1Q16706 1144 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 SARM1Q6SZW1 724 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 KLK14Q9P0G3 267 aa22.72■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GTH6 734 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 TEX33O43247 280 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 RAB27AP51159 221 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 TPM4P67936 248 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 VWA3BQ502W6 1294 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 MIOSQ9NXC5 875 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 IFNKQ9P0W0 207 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 COL4A6Q14031 1691 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG3-202ENST00000617158 PTGESO14684 152 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 NFICP08651 508 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ITGA4P13612 1032 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 KRT13P13646 458 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 KCNH2Q12809 1159 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 NR1I3Q14994 352 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CBWD6Q4V339 395 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 DPF3Q92784 378 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CGRRF1Q99675 332 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 LGALS16A8MUM7 142 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB6Q15916 424 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PTPN21Q16825 1174 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 JADE1Q6IE81 842 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 FAM212AQ96EL1 285 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ZFP42Q96MM3 310 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 NDST4Q9H3R1 872 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CNTN3Q9P232 1028 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PARP2Q9UGN5 583 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 INPPL1O15357 1258 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 IL18RAPO95256 599 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SKIP12755 728 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 GCLMP48507 274 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 FPGSQ05932 587 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 IKBKEQ14164 716 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 CXorf38Q8TB03 319 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 GAD1Q99259 594 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ASB7Q9H672 318 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 LRRN2O75325 713 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 OFD1O75665 1012 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 EOMESO95936 686 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 SERPINC1P01008 464 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 PFKMP08237 780 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 KCNE1P15382 129 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 FMO5P49326 533 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 UBASH3AP57075 661 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 NAB2Q15742 525 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM240Q5SV17 173 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF365Q70YC5 407 aa22.67■■□□□ 1.22
CSAG3-202ENST00000617158 RNF169Q8NCN4 708 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms