RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRS-209ENST00000591760 ABLIM1O14639 778 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TBCAO75347 108 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 KIF4AO95239 1232 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 DDIT3P35638 169 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF131P52739 623 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 OSTNP61366 133 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CREMQ03060 361 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.13e-9■□□□□ 8.5
PTPRS-209ENST00000591760 GLRA4Q5JXX5 417 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 HAUS6Q7Z4H7 955 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 MYCT1Q8N699 235 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 KCNN1Q92952 543 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 SFXN1Q9H9B4 322 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RXFP1Q9HBX9 757 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 STK17AQ9UEE5 414 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TEX28O15482 410 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 MTHFRP42898 656 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 SLC39A14Q15043 492 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 USP49Q70CQ1 688 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RNF135Q8IUD6 432 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 HASPINQ8TF76 798 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 BICD1Q96G01 975 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 UROC1Q96N76 676 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CLIC6Q96NY7 704 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ACAP3Q96P50 834 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 DPP7Q9UHL4 492 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 K7ENM7 598 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 B3GALT6Q96L58 329 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 SNX27Q96L92 541 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TRIP11Q15643 1979 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 PLXNA3P51805 1871 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CLDN3O15551 220 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 GPR37L1O60883 481 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 GLUD1P00367 558 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ABCD1P33897 745 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 NASPP49321 788 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 XKR4Q5GH76 650 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ALKAL1Q6UXT8 129 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ZHX3Q9H4I2 956 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 FNIP2Q9P278 1114 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 NR2E1Q9Y466 385 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CITO14578 2027 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TRAK2O60296 914 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 MCL1Q07820 350 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 STK38Q15208 465 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ATAT1Q5SQI0 421 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RRAGBQ5VZM2 374 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TTPALQ9BTX7 342 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CDH22Q9UJ99 828 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TBX20Q9UMR3 447 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 C1RP00736 705 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 LIG4P49917 911 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 RTP2Q5QGT7 225 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 FAM171A1Q5VUB5 890 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 POMKQ9H5K3 350 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 C11orf16Q9NQ32 467 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CNTN3Q9P232 1028 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 B3GAT3O94766 335 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 KCNE1P15382 129 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CLCNKBP51801 687 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 UPP1Q16831 310 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 PDXDC1Q6P996 788 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 TMC5Q6UXY8 1006 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 LRFN3Q9BTN0 628 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRS-209ENST00000591760 FAM86C2PA6NEL3 165 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 WEE2P0C1S8 567 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 KANK3Q6NY19 840 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 CEP57Q86XR8 500 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 PIK3R5Q8WYR1 880 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRS-209ENST00000591760 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.13■■■□□ 2.09
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