RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 GJB7Q6PEY0 223 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 RNF180Q86T96 592 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF516Q92618 1163 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM81BQ96LP2 452 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 OSMRQ99650 979 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 RAB20Q9NX57 234 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.22
EFTUD2-214ENST00000589769 OFD1O75665 1012 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CLTAP09496 248 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SOX5P35711 763 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 STAT1P42224 750 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 GCNT1Q02742 428 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP120Q8N960 986 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 HELQQ8TDG4 1101 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC42Q96M95 316 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 NT5C1BQ96P26 610 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 GFPT2O94808 682 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 VNN1O95497 513 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 HLA-DRAP01903 254 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TNNI1P19237 187 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 GRM5P41594 1212 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 KRT83P78385 493 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SEZ6Q53EL9 994 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 LHX8Q68G74 356 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 NOTUMQ6P988 496 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SHC3Q92529 594 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CPB2Q96IY4 423 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ADPGKQ9BRR6 497 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SYT11Q9BT88 431 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 NENFQ9UMX5 172 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 GRIN2DO15399 1336 aa16.38■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CITO14578 2027 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF263O14978 683 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 LRRN2O75325 713 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 STAG3L1P0CL83 205 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CXCL8P10145 99 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ARHGAP25P42331 645 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 PIK3CAP42336 1068 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ACLYP53396 1101 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 MGAT3Q09327 533 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPN14Q15678 1187 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 RSPH3Q86UC2 560 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 ASB7Q9H672 318 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM17Q9Y577 477 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.37■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 EVI5O60447 810 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC172P0C7W6 258 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 VAV2P52735 878 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 MFAP3P55082 362 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC18A3Q16572 532 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 CD302Q8IX05 232 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-214ENST00000589769 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms