RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 OR7D4Q8NG98 312 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF566Q969W8 418 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 SKA1Q96BD8 255 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 RMDN3Q96TC7 470 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 LANCL2Q9NS86 450 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAI1Q9UI46 699 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.34□□□□□ -1.39
PIK3C3-211ENST00000589550 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A1B0GVC2 190 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 F8W8V4 182 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 IL18BPO95998 194 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 GAAP10253 952 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 POLD1P28340 1107 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 SREBF1P36956 1147 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 GLRBP48167 497 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 WNT3AP56704 352 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 UBE3CQ15386 1083 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 ZACNQ401N2 412 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 LCE3BQ5TA77 95 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 EMC10Q5UCC4 262 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 RFX8Q6ZV50 586 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 ABHD4Q8TB40 342 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB24Q969Q5 203 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 IQCDQ96DY2 449 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PPM1MQ96MI6 270 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF32Q9H0A6 362 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 KCND1Q9NSA2 647 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 RRN3Q9NYV6 651 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PDP2Q9P2J9 529 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.33□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A0G2JNJ9 132 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 OR14I1A6ND48 311 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 NCAM2O15394 837 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 AGR2O95994 175 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 GASTP01350 101 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CHGBP05060 677 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM163BP0C2L3 166 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 FGFR2P21802 821 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PRDX5P30044 214 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CRHR1P34998 444 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 ARFIP2P53365 341 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 FOXO1Q12778 655 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 GRM1Q13255 1194 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PRKG1Q13976 671 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 HYIQ5T013 277 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM140Q9NV12 185 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 STK32BQ9NY57 414 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 COL20A1Q9P218 1284 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 Q9UFV3 132 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.32□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 HRKO00198 91 aa6.31□□□□□ -1.4
PIK3C3-211ENST00000589550 N4BP3O15049 544 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms