RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 APOL6Q9BWW8 343 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PPME1Q9Y570 386 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ABLIM1O14639 778 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMA7O14818 248 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MGEA5O60502 916 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NBNO60934 754 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NPTXRO95502 500 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SYN1P17600 705 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NR2F2P24468 414 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ACOT2P49753 483 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 STRN3Q13033 797 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA1Q5VX52 437 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP135Q66GS9 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPPQ6IPU0 288 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LYPD8Q6UX82 237 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF410Q86VK4 478 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CDT1Q9H211 546 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMX1Q9H3N1 280 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FZD8Q9H461 694 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HES2Q9Y543 173 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.59□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE4BO95155 1302 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FSD2A1L4K1 749 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BECN2A8MW95 431 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 M0QZ92 97 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ACKR2O00590 384 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ASAP2O43150 1006 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS6KA5O75582 802 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP3O75969 853 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ERLIN2O94905 339 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CLTBP09497 229 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM49P0CI25 452 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM49CP0CI26 452 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ACRP10323 421 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DLG4P78352 724 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL5Q02045 173 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 STIM1Q13586 685 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK6Q16659 721 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM26DQ5JW98 314 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 UBXN11Q5T124 520 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZVU0 165 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.58□□□□□ -1.36
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