RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579531.5

MSI2-211, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 2

Gene MSI2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-211	ENST00000579531	PHF2	O75151	1096 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	OFD1	O75665	1012 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	LPL	P06858	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TBX4	P57082	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CD83	Q01151	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	GLI3	P10071	1580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ATRN	O75882	1429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CRB1	P82279	1406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	OSM	P13725	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF28	P17035	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MCC	P23508	829 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IL13	P35225	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IL12RB1	P42701	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	LRRC41	Q15345	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ADRM1	Q16186	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	IP6K1	Q92551	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	BCL9	O00512	1426 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSI2-211	ENST00000579531	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	PLIN1	O60240	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	TSPAN15	O95858	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	HMGCR	P04035	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	COL6A1	P12109	1028 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	C5AR1	P21730	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	LIMS1	P48059	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	MEOX1	P50221	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	WNT3A	P56704	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	ODF1	Q14990	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	KDR	P35968	1356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	LY75	O60449	1722 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	KLHL18	O94889	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	ENDOD1	O94919	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	MYL1	P05976	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	GNAL	P38405	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	MCAM	P43121	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	CDK17	Q00537	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	MGAT2	Q10469	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	VPS72	Q15906	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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