RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF605Q86T29 641 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FAM168AQ92567 244 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TIFAQ96CG3 184 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DDX11Q96FC9 970 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TESK2Q96S53 571 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MAFGO15525 162 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFS2O75306 463 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SRGNP10124 158 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM27P14373 513 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ATF2P15336 505 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NPR1P16066 1061 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 C5AR1P21730 350 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NKX3-2P78367 333 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PFKPQ01813 784 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GBX1Q14549 363 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PPM1NQ8N819 430 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 WDR48Q8TAF3 677 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CALML6Q8TD86 181 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TTC17Q96AE7 1141 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 COL15A1P39059 1388 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MC3RP41968 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CDR1P51861 262 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SLC16A1P53985 500 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GRM3Q14832 879 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KCNK18Q7Z418 384 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DTX3Q8N9I9 347 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SARGQ9BW04 601 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 INCENPQ9NQS7 918 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GALNT8Q9NY28 637 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DPP7Q9UHL4 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 USP25Q9UHP3 1055 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DTNBO60941 627 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS4P56470 323 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PICALMQ13492 652 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SPIDRQ14159 915 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MUM1Q2TAK8 710 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 VASNQ6EMK4 673 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 RUNDC1Q96C34 613 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MAP3K14Q99558 947 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SYT3Q9BQG1 590 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KCNK12Q9HB15 430 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 POLKQ9UBT6 870 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PCDH8O95206 1070 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 RGS3P49796 1198 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NCKAP1LP55160 1127 aa6.67□□□□□ -1.34
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