RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, human

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC1-208	ENST00000576557	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	WNT7A	O00755	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CCL16	O15467	120 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ADAM12	O43184	909 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	KIF4A	O95239	1232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	C1R	P00736	705 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	C8A	P07357	584 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LIG1	P18858	919 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TUSC3	Q13454	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PSMD5	Q16401	504 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PTGES	O14684	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GJB2	P29033	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	WASF1	Q92558	559 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FGF13	Q92913	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	NEMF	O60524	1076 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TH	P07101	528 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CD72	P21854	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	STARD6	P59095	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SHD	Q96IW2	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FZD8	Q9H461	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	N4BP3	O15049	544 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	XYLB	O75191	536 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	RECQL4	O94761	1208 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	EDN1	P05305	212 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	OR1D2	P34982	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	NAB2	Q15742	525 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	RUBCN	Q92622	972 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	F5	P12259	2224 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCC1-208	ENST00000576557	FRYL	O94915	3013 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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