RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	TADA2A	O75478	443 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	FAM13A	O94988	1023 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	C1R	P00736	705 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ADH1A	P07327	375 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	SPECC1	Q5M775	1068 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ZBTB33	Q86T24	672 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CEP120	Q8N960	986 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CLIC6	Q96NY7	704 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	TCHP	Q9BT92	498 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	C2CD2L	O14523	706 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	TEX28	O15482	410 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	DCX	O43602	365 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	KIF4A	O95239	1232 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ABCD1	P33897	745 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	MTHFR	P42898	656 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CREM	Q03060	361 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	MYCT1	Q8N699	235 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	SNX27	Q96L92	541 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	FBXL18	Q96ME1	805 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	UROC1	Q96N76	676 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ACAP3	Q96P50	834 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	APOL5	Q9BWW9	433 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	FNIP2	Q9P278	1114 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	MYO10	Q9HD67	2058 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784		K7ENM7	598 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CLDN3	O15551	220 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	TRAK2	O60296	914 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	GPR37L1	O60883	481 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	PIGR	P01833	764 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	KCNE1	P15382	129 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	OSTN	P61366	133 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	MCL1	Q07820	350 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	STK38	Q15208	465 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	RNF135	Q8IUD6	432 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	RABGGTA	Q92696	567 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	FIZ1	Q96SL8	496 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	CNTN3	Q9P232	1028 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	DPP7	Q9UHL4	492 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	TBX20	Q9UMR3	447 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PKD1-231	ENST00000566784	ANK1	P16157	1881 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	PPP6R2	O75170	966 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	GLUD1	P00367	558 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	GTF2B	Q00403	316 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	UPP1	Q16831	310 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	BICD1	Q96G01	975 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	B3GALT6	Q96L58	329 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	NR2E1	Q9Y466	385 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	TRIO	O75962	3097 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	SPTLC2	O15270	562 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	TECTA	O75443	2155 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	YEATS4	O95619	227 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	LIG4	P49917	911 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	CLCNKB	P51801	687 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	KYAT1	Q16773	422 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PKD1-231	ENST00000566784	PDXDC1	Q6P996	788 aa		15.13	■□□□□ 0.01

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