RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAS1R2Q8TE23 839 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELMO3Q96BJ8 720 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR88Q9GZN0 384 aa19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 TREHO43280 583 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR32O75388 356 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAGEA1P43355 309 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 VAV2P52735 878 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 EEF1DP3Q658K8 133 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXL13Q8NEE6 735 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCLT1Q96NL6 688 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB20Q9NX57 234 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa19.27■□□□□ 0.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 OGTO15294 1046 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 EVI5O60447 810 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 FERP16591 822 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRKCIP41743 596 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLAIN1Q8ND83 568 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 KAT5Q92993 513 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUSP10Q9Y6W6 482 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRJQ12913 1337 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19.26■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A087X0T9 212 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM228BP0C875 321 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFX1P22670 979 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIZQ2M2Z5 673 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF568Q3ZCX4 644 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC35F6Q8N357 371 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT86O43790 486 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF5AQ12840 1032 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNA10Q16322 511 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC18A3Q16572 532 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF662Q6ZS27 426 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRSK2Q8IWQ3 736 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 THNSL1Q8IYQ7 743 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPM1KQ8N3J5 372 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 NME8Q8N427 588 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYRIPQ8NFW9 859 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJB3Q8WWF6 145 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM212AQ96EL1 285 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CGRRF1Q99675 332 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PI4K2AQ9BTU6 479 aa19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 UQCRHLA0A096LP55 91 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASGR1P07306 291 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 UQCRHP07919 91 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TERF1P54274 439 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 OSTNP61366 133 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 BIRC3Q13489 604 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF2Q6P1X5 1199 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TATDN2Q93075 761 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPB2Q96IY4 423 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 NT5C1BQ96P26 610 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDT1Q9H211 546 aa19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPAN1O60635 241 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 URI1O94763 535 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 INHAP05111 366 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZACNQ401N2 412 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 SESTD1Q86VW0 696 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 KREMEN1Q96MU8 473 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDZD7Q9H5P4 517 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 GINS2Q9Y248 185 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 MACROD2A1Z1Q3 448 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERLIN2O94905 339 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 HLA-DRAP01903 254 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCF2P10911 925 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGFR4P22455 802 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRK4P32298 578 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP8P40818 1118 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF180Q86T96 592 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP120Q8N960 986 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5B17Q8NGF7 314 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 HELQQ8TDG4 1101 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSGA10Q9BZW7 698 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDHR5Q9HBB8 845 aa19.23■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCNTO95613 3336 aa19.22■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GUA9 196 aa19.22■□□□□ 0.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 VNN1O95497 513 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms