RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SEMA4DQ92854 862 aa25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 FAM81BQ96LP2 452 aa25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.26■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 HSD17B4P51659 736 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 VSTM1Q6UX27 236 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 NT5C1BQ96P26 610 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ACP6Q9NPH0 428 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 O00370 1275 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ACSL3O95573 720 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 IVDP26440 423 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GALNTL6Q49A17 601 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GAS8O95995 478 aa25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GRIN3BO60391 1043 aa25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TMC2Q8TDI7 906 aa25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 MAPK4P31152 587 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SLC1A1P43005 524 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 NSMFQ6X4W1 530 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 FEM1BQ9UK73 627 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 UBOX5O94941 541 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GTF2H1P32780 548 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TCP11Q8WWU5 503 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SLC16A4O15374 487 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SORBS3O60504 671 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CHKAP35790 457 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 PEX3P56589 373 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 LRRC14Q15048 493 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 E2F5Q15329 346 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 USP37Q86T82 979 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ATL2Q8NHH9 583 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 VEZTQ9HBM0 779 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 RAB20Q9NX57 234 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ANAPC7Q9UJX3 599 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 GJB6O95452 261 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 NCALDP61601 193 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 DCLK3Q9C098 648 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CHST7Q9NS84 486 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 A0A1B0GUA9 196 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CLTAP09496 248 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ITGA8P53708 1063 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 CENPCQ03188 943 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 BNIP1Q12981 228 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 NUGGCQ68CJ6 796 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 C4orf19Q8IY42 314 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 BBOF1Q8ND07 529 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 MYBL1P10243 752 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ATF2P15336 505 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ADSSP30520 456 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 ENPEPQ07075 957 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 PTP4A2Q12974 167 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SNX1Q13596 522 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 MGARPQ8TDB4 240 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 TRIM11Q96F44 468 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.21■■□□□ 1.63
NPAS3-211ENST00000551634 SPATA21Q7Z572 469 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms