RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CSRP2	Q16527	193 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRR16	Q569H4	304 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BROX	Q5VW32	411 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKS6	Q68DC2	871 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RASSF3	Q86WH2	238 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF169	Q8NCN4	708 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC5A5	Q92911	643 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EMC7	Q9NPA0	242 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RPTOR	Q8N122	1335 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PJA2	O43164	708 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KATNA1	O75449	491 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDKL5	O76039	1030 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ESRRB	O95718	433 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDK4	P11802	303 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	REST	Q13127	1097 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MPP3	Q13368	585 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TP53BP2	Q13625	1128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MAP9	Q49MG5	647 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C14orf80	Q86SX3	495 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MFSD3	Q96ES6	412 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FEZ1	Q99689	392 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADAM2	Q99965	735 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TEX101	Q9BY14	249 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RSAD1	Q9HA92	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SPDEF	O95238	335 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CFI	P05156	583 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ITGAM	P11215	1152 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FDXR	P22570	491 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LGALS4	P56470	323 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBX4	P57082	545 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CLRN1	P58418	232 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RHBDL3	P58872	404 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GORAB	Q5T7V8	394 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC181	Q5TID7	509 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CAGE1	Q8TC20	777 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ASB10	Q8WXI3	467 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CEP95	Q96GE4	821 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAX2	Q96IS3	184 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ACAP3	Q96P50	834 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHST12	Q9NRB3	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DRGX	A6NNA5	263 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C1R	P00736	705 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LPL	P06858	475 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PTPN7	P35236	360 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHN2	P52757	468 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FOXI1	Q12951	378 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	UGT8	Q16880	541 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MST1L	Q2TV78	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	COLEC12	Q5KU26	742 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DRC7	Q8IY82	874 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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