RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521418.1

POLB-210, Transcript of DNA polymerase beta, humanhuman

TSL 2

Gene POLB, Length 628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLB-210ENST00000521418 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.16□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.16□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ZNF263O14978 683 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CCL16O15467 120 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ATG13O75143 517 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 DDHD2O94830 711 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ERLIN2O94905 339 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 SDSP20132 328 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ADCY7P51828 1080 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 SATB1Q01826 763 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 AMHR2Q16671 573 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 MSS51Q4VC12 460 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 FUT10Q6P4F1 479 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 LILRA6Q6PI73 481 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CASC1Q6TDU7 716 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 C11orf74Q86VG3 221 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ELMOD1Q8N336 334 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 NCOA7Q8NI08 942 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 E2F7Q96AV8 911 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CCDC51Q96ER9 411 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 CHST7Q9NS84 486 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.15□□□□□ -1.26
POLB-210ENST00000521418 ZZEF1O43149 2961 aa7.15□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 A0A087WZ62 844 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CCDC69A6NI79 296 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 LCE2BO14633 110 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CCNE2O96020 404 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 LRG1P02750 347 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PSMC3P17980 439 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 AXLP30530 894 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SFNP31947 248 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ELF1P32519 619 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SREBF1P36956 1147 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 JAK3P52333 1124 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PDE1AP54750 535 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 NAPAP54920 295 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRKCEQ02156 737 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 FZD5Q13467 585 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PTPAQ15257 358 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PDZD3Q86UT5 571 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ITFG1Q8TB96 612 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 EXOC4Q96A65 974 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 NLRP4Q96MN2 994 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TTPALQ9BTX7 342 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ANO3Q9BYT9 981 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MARCH5Q9NX47 278 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.14□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ARL5CA6NH57 179 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 C4orf47A7E2U8 309 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MICAL2O94851 1124 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CHRNB1P11230 501 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PTPN2P17706 415 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SPINK2P20155 84 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ATP4AP20648 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CCNE1P24864 410 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GDI1P31150 447 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RAP1GAPP47736 663 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 NTHL1P78549 312 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms