RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110		E9PMD0	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ST18	O60284	1047 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CFH	P08603	1231 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	LAMP2	P13473	410 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	AOC1	P19801	751 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PTGDR	Q13258	359 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PDIA5	Q14554	519 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	IL17A	Q16552	155 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DAW1	Q8N136	415 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110		K7ERI5	159 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CDC25A	P30304	524 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	NBL1	P41271	181 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CLCNKB	P51801	687 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PEX3	P56589	373 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	NTHL1	P78549	312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	HTR4	Q13639	388 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CEP120	Q8N960	986 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110		I3L4J1	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CCL16	O15467	120 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	HIP1R	O75146	1068 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	C8A	P07357	584 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	SRF	P11831	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	FGFR3	P22607	806 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	FSHR	P23945	695 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	NPTX2	P47972	431 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	MAPK7	Q13164	816 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	UPP1	Q16831	310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	CDT1	Q9H211	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DMD	P11532	3685 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	B3GAT3	O94766	335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	OR1D2	P34982	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	GRM5	P41594	1212 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	BRCC3	P46736	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	OSTN	P61366	133 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB33A	Q14088	237 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG4-208	ENST00000514110	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms