RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP20Q9Y2K6 914 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPR182O15218 404 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 B4GALT4O60513 344 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPAN1O60635 241 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GFPT2O94808 682 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFA10O95299 355 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STAG3L1P0CL83 205 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 P4HA1P13674 534 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOX5P35711 763 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BPIFB4P59827 614 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTK7Q13308 1070 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPC2Q52LR7 807 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM139Q8IV31 216 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP38Q8NB14 1042 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BAP1Q92560 729 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TAF4BQ92750 862 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDT1Q9H211 546 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 B4GALT5O43286 388 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT86O43790 486 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF5CO60282 957 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS6KA5O75582 802 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOL4O94818 638 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACTN1P12814 892 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRM5P41594 1212 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARID5AQ03989 594 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNX17Q15036 470 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZACNQ401N2 412 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IQCEQ6IPM2 695 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SERINC5Q86VE9 423 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CPB2Q96IY4 423 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHST12Q9NRB3 414 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DERAQ9Y315 318 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HLA-DRAP01903 254 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SKIP12755 728 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 THPOP40225 353 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP8P40818 1118 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OSTNP61366 133 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCNT1Q02742 428 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF5AQ12840 1032 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCOA4Q13772 614 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AMHR2Q16671 573 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADGRG1Q9Y653 693 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F8VZ95 297 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNM1LO00429 736 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPHB6O15197 1021 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPTXRO95502 500 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TNNT1P13805 278 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CAPN2P17655 700 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TNFAIP3P21580 790 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATICP31939 592 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRKCIP41743 596 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF11P52732 1056 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JAM2P57087 298 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms