RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 CEP120Q8N960 986 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 MED15Q96RN5 788 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 APOL6Q9BWW8 343 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 CERS4Q9HA82 394 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF233A6NK53 670 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 C9IYK1 514 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 IKBKBO14920 756 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 CLTAP09496 248 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 STAG3L1P0CL83 205 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ITGA4P13612 1032 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 SEZ6Q53EL9 994 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 RDH13Q8NBN7 331 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 RNF169Q8NCN4 708 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ACAP3Q96P50 834 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 CBX8Q9HC52 389 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 SNTG2Q9NY99 539 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 HES2Q9Y543 173 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF623O75123 536 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 GJB5O95377 273 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 TPM4P67936 248 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 THAP9Q9H5L6 903 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 PARP2Q9UGN5 583 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.83■■□□□ 1.09
SMIM20-201ENST00000506197 LCHNA4D1U4 455 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 EPOPA6NHQ4 379 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 FAM189A1O60320 539 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 GNA14O95837 355 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 EOMESO95936 686 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 AMHP03971 560 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 TNFSF9P41273 254 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 CASP4P49662 377 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 FBXL18Q96ME1 805 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 THEGQ9P2T0 379 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 NCOR1O75376 2440 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 RFXAPO00287 272 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 MAPK13O15264 365 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 AKAP3O75969 853 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 RECQL4O94761 1208 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 KRT13P13646 458 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 AKAP5P24588 427 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 FAM189BP81408 668 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 IQCB1Q15051 598 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM192Q8IY95 271 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 FAM212AQ96EL1 285 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 RAD9AQ99638 391 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.81■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 ADRB2P07550 413 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 CXCL8P10145 99 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 SURF1Q15526 300 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM20-201ENST00000506197 USP37Q86T82 979 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms