RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LUZP1Q86V48 1076 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NCLNQ969V3 563 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS39Q96JC1 886 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EHD2Q9NZN4 543 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CASZ1Q86V15 1759 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 PALLDQ8WX93 1383 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 C4BP0C0L5 1744 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 M0R2N6 131 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 BACH1O14867 736 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF8O76064 485 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 MICAL2O94851 1124 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 OR5F1O95221 314 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM11P17152 192 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 IL32P24001 234 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 HNF1BP35680 557 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 GPC3P51654 580 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 INHBCP55103 352 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CCNA1P78396 465 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXK2Q01167 660 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ACY1Q03154 408 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 GNA13Q14344 377 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 LETM2Q2VYF4 491 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 C4orf17Q53FE4 359 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 VSIG1Q86XK7 387 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 SPATA5Q8NB90 893 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 IPMKQ8NFU5 416 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 STON2Q8WXE9 905 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CASP10Q92851 521 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 FNBP1Q96RU3 617 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 C12orf10Q9HB07 376 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 OBP2AQ9NY56 170 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 MALT1Q9UDY8 824 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 AMACRQ9UHK6 382 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BM21 787 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CDK2AP1O14519 115 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFB5O43674 189 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CTSHP09668 335 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP2B4P23634 1241 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 STAT1P42224 750 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CABP4P57796 275 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 DPYDQ12882 1025 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 SQLEQ14534 574 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CRY1Q16526 586 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ANO4Q32M45 955 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 TNS4Q8IZW8 715 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms