RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	MYH10	P35580	1976 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	LTBP2	Q14767	1821 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	EPHB6	O15197	1021 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CXCL8	P10145	99 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	SKIL	P12757	684 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	WNT7B	P56706	349 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	OSTN	P61366	133 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CD302	Q8IX05	232 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CEP120	Q8N960	986 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ASB7	Q9H672	318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CD4	P01730	458 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CKB	P12277	381 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ACTN1	P12814	892 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	UCHL3	P15374	230 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	KCNJ6	P48051	423 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	GJA8	P48165	433 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	PAK2	Q13177	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	BFSP2	Q13515	415 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	BAP1	Q92560	729 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	DERA	Q9Y315	318 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TTC3	P53804	2025 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TNNC2	P02585	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	COL6A1	P12109	1028 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	JAM2	P57087	298 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKP4-215	ENST00000494945	CDK17	Q00537	523 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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