RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 FAM84AQ96KN4 292 aa21.51■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.51■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 OGTO15294 1046 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RTN2O75298 545 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PPFIA4O75335 1185 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 INSRRP14616 1297 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CYP11B1P15538 503 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TNNI1P19237 187 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CXCR5P32302 372 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 AP3M2P53677 418 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 FMO1Q01740 532 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TINF2Q9BSI4 451 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 OGFRQ9NZT2 677 aa21.5■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MAGEB2O15479 319 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CDR2Q01850 454 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RPS6KA1Q15418 735 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 FAM187BQ17R55 369 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 DPP9Q86TI2 863 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 KAT6AQ92794 2004 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MGAMO43451 1857 aa21.49■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MTA2O94776 668 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 USP8P40818 1118 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PAFAH1B1P43034 410 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CLCN3P51790 818 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 VSNL1P62760 191 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RUBCNQ92622 972 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PSMB7Q99436 277 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 THAP2Q9H0W7 228 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 65.2
NELFE-211ENST00000492185 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D8O95759 1140 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SMPD1P17405 629 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PIK3CAP42336 1068 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 C2orf54Q08AI8 447 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 WDR44Q5JSH3 913 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MORN1Q5T089 497 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 WDR49Q8IV35 697 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PBKQ96KB5 322 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.48■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 GJB1P08034 283 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ACVR2BQ13705 512 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SURF1Q15526 300 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 HES6Q96HZ4 224 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.47■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MMEP08473 750 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TNFSF9P41273 254 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 PDE6CP51160 858 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 CCDC181Q5TID7 509 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ACP6Q9NPH0 428 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 EHD2Q9NZN4 543 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ERLIN1O75477 346 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MMP3P08254 477 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ABCB4P21439 1286 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MCM3P25205 808 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 HUNKP57058 714 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 BIRC3Q13489 604 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms