RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT36	O76013	467 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ETS2	P15036	469 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TNNI1	P19237	187 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SERPINB6	P35237	376 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PEX5	P50542	639 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARFIP2	P53365	341 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF543	Q08ER8	600 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RIPK1	Q13546	671 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT10	P13645	584 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PGM1	P36871	562 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	VAMP7	P51809	220 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CUL3	Q13618	768 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	AMN	Q9BXJ7	453 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RTN2	O75298	545 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP5H	O75947	161 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT4	P19013	534 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	HSPA1L	P34931	641 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	DLG4	P78352	724 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CPXCR1	Q8N123	301 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC89	Q8N998	374 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MT-ND3	P03897	115 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ITIH2	P19823	946 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MFAP3	P55082	362 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MPP2	Q14168	576 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FGR	P09769	529 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GAP43	P17677	238 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	VCAM1	P19320	739 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PRKCI	P41743	596 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARSE	P51690	589 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF394	Q53GI3	561 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BRJ5	948 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC16A4	O15374	487 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	BANF1	O75531	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GJB6	O95452	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT1	P04264	644 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXN2	P32314	431 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	VHL	P40337	213 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	NPEPPS	P55786	919 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PEX3	P56589	373 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	LIN9	Q5TKA1	542 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ATL2	Q8NHH9	583 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB20	Q9NX57	234 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292		B2RBV5	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292		I3L4J1	428 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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