RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 ESX1Q8N693 406 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL17REQ8NFR9 667 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDE1Q9NXR1 346 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PEAK1Q9H792 1746 aa7.32□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 K7EPI3 171 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 OCM2P0CE71 109 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP6V1B1P15313 513 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENPP1P22413 925 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD17B4P51659 736 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NCOA4Q13772 614 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRY1Q16526 586 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LPCAT4Q643R3 524 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF410Q86VK4 478 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LZTR1Q8N653 840 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP6NLQ92738 828 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAR1AQ9NR31 198 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF536O15090 1300 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM75PA6NK02 468 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 A6NL46 340 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTC34A8MYJ7 566 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLRC4O43908 158 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOEP02649 317 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PON1P27169 355 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DR1Q01658 176 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL17AQ16552 155 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHKG1Q16816 387 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.31□□□□□ -1.24
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CACNA2D3-210ENST00000490478 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PASD1Q8IV76 773 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS52Q8N1B4 723 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SKA1Q96BD8 255 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PANX3Q96QZ0 392 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 EHD1Q9H4M9 534 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LZTS1Q9Y250 596 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DISP2A7MBM2 1401 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDC80O14777 642 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB43O43298 467 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNB1P11230 501 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASPHQ12797 758 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNJ8Q15842 424 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GINM1Q9NU53 330 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 A8MXQ7 604 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAMBPO95630 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CETPP11597 493 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHKA2P46019 1235 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSSP48637 474 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGEF6Q15052 776 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF174Q15697 407 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TXNRD1Q16881 649 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO27Q8NI29 283 aa7.3□□□□□ -1.24
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