RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 HTR4Q13639 388 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 EMC2Q15006 297 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF174Q15697 407 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CSRP2Q16527 193 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 KSR1Q8IVT5 923 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 FGF14Q92915 247 aa7.14□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 COL12A1Q99715 3063 aa7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.14□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 CHST12Q9NRB3 414 aa7.14□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CTSAP10619 480 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.13□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.13□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PARM1Q6UWI2 310 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.13□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 ERMNQ8TAM6 284 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.13□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 IRAK3Q9Y616 596 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 EML5Q05BV3 1969 aa7.13□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CLUHO75153 1309 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.12□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 MED24O75448 989 aa7.12□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA31D3P0C874 917 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SKIP12755 728 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 LAMP2P13473 410 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 MUTP22033 750 aa7.12□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 PHKA2P46019 1235 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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CTDSPL-208ENST00000486978 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 MCTP1Q6DN14 999 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC43Q8N309 656 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF149Q8NC42 400 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF169Q8NCN4 708 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAM32Q8TC27 787 aa7.12□□□□□ -1.27
CTDSPL-208ENST00000486978 HELQQ8TDG4 1101 aa7.12□□□□□ -1.27
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