RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TCHPQ9BT92 498 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 HIP1RO75146 1068 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 UROC1Q96N76 676 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TIPINQ9BVW5 301 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 MYH11P35749 1972 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TRIP11Q15643 1979 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PP2D1A8MPX8 630 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC3O43617 180 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ZMYND10O75800 440 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 B3GAT3O94766 335 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 EDN1P05305 212 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 RFX1P22670 979 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 NPTX2P47972 431 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TCF15Q12870 199 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 STRN3Q13033 797 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 LILRA6Q6PI73 481 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 FLCNQ8NFG4 579 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 NXPE3Q969Y0 559 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.135e-8■□□□□ 10.5
ACTB-212ENST00000484841 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CDC25AP30304 524 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 STK25O00506 426 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GJB2P29033 226 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GRM5P41594 1212 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 MCM2P49736 904 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CLCN5P51795 746 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CLCNKBP51801 687 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SMTNP53814 917 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 OSTNP61366 133 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TMX3Q96JJ7 454 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 POLIQ9UNA4 740 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 H0Y858 1186 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 XYLBO75191 536 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 FSHRP23945 695 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 NAB2Q15742 525 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ACAP3Q96P50 834 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SLC16A4O15374 487 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 C8AP07357 584 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 MCF2P10911 925 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 IL17AQ16552 155 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SIX5Q8N196 739 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 MYADMQ96S97 322 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PHOX2BQ99453 314 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CDT1Q9H211 546 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 TRIOO75962 3097 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CITO14578 2027 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 VWA8A3KMH1 1905 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 SFI1A8K8P3 1242 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 CFHP08603 1231 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 LAMP2P13473 410 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GUCY2CP25092 1073 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 OR1D2P34982 312 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.08■■□□□ 1.13
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