RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 ALDH2P05091 517 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 KIR2DL3P43628 341 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 MEOX1P50221 254 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CDC42EP1Q00587 391 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 BIRC2Q13490 618 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 IL10RAQ13651 578 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 Q6ZVL8 140 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PMM1Q92871 262 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CHST12Q9NRB3 414 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 USP25Q9UHP3 1055 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 L1RE1Q9UN81 338 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 POLHQ9Y253 713 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SYNMO15061 1565 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ARIH2O95376 493 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ECHS1P30084 290 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CRHR1P34998 444 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SARSP49591 514 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM193AP78312 1265 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PICALMQ13492 652 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SSPNQ14714 243 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PCOLCEQ15113 449 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ANO6Q4KMQ2 910 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 COBLL1Q53SF7 1204 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 DRC7Q8IY82 874 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CGRRF1Q99675 332 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 LRFN3Q9BTN0 628 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 OR10A2Q9H208 303 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 JADE2Q9NQC1 790 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 KCTD3Q9Y597 815 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 E9PCH4 1651 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PREX1Q8TCU6 1659 aa7□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 C2orf78A6NCI8 922 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 RFXAPO00287 272 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ALDH1A2O94788 518 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PI3P19957 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CSF2RBP32927 897 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC6A9P48067 706 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 MRE11P49959 708 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 HK3P52790 923 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ADAM15Q13444 863 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 GAGE13Q4V321 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF385BQ569K4 471 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 OR7D4Q8NG98 312 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF480Q8WV37 535 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SPATA25Q9BR10 227 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CD320Q9NPF0 282 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 A0A088AWK7 358 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 PRAMEF4O60810 478 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 HTR1BP28222 390 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 SREBF1P36956 1147 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 MAP2K6P52564 334 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CACNB3P54284 484 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 GPSM2P81274 684 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 RAB39AQ14964 217 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 VPS72Q15906 364 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 AGBL4Q5VU57 503 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 NPNTQ6UXI9 565 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 CARFQ8N187 725 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 C3orf20Q8ND61 904 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 KAT5Q92993 513 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 RGMAQ96B86 450 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM167AQ96KS9 214 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGAP1-210ENST00000480054 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms