RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478725.5

GUK1-223, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 3

Gene GUK1, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-223	ENST00000478725	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CREM	Q03060	361 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	XKR4	Q5GH76	650 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZPBP2	Q6X784	338 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	GPR149	Q86SP6	731 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZBTB33	Q86T24	672 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	RAD54L	Q92698	747 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	EDA	Q92838	391 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TCHP	Q9BT92	498 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FNIP2	Q9P278	1114 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	DPP7	Q9UHL4	492 aa		15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SCP2	P22307	547 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZNF131	P52739	623 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	NCKAP1L	P55160	1127 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	OSTN	P61366	133 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SNX21	Q969T3	373 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SNX27	Q96L92	541 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	UROC1	Q96N76	676 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	UST	Q9Y2C2	406 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	STX6	O43752	255 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	B3GAT3	O94766	335 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	FAM13A	O94988	1023 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZXDA	P98168	799 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MCM6	Q14566	821 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PTPN21	Q16825	1174 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	UPP1	Q16831	310 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	USP49	Q70CQ1	688 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	EPSTI1	Q96J88	318 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ACAP3	Q96P50	834 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PARVG	Q9HBI0	331 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CLDN3	O15551	220 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TGM5	O43548	720 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PAPLN	O95428	1278 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	KCNE1	P15382	129 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	DDIT3	P35638	169 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CLCNKB	P51801	687 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MCL1	Q07820	350 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	SPECC1	Q5M775	1068 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	LILRA6	Q6PI73	481 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CEP57	Q86XR8	500 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PALB2	Q86YC2	1186 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	MYCT1	Q8N699	235 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	USP28	Q96RU2	1077 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	CNTN3	Q9P232	1028 aa		14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
GUK1-223	ENST00000478725		K7ENM7	598 aa		14.96	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms