RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 VPS18Q9P253 973 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TRPC6Q9Y210 931 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ALG6Q9Y672 507 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.01□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SOWAHBA6NEL2 793 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC169A6NNP5 214 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 H0YGN5 161 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 KRIT1O00522 736 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SOCS7O14512 581 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CEP104O60308 925 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MSCO60682 206 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PHF2O75151 1096 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LRRN2O75325 713 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PPFIA2O75334 1257 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZMYND10O75800 440 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SGPL1O95470 568 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 IVLP07476 585 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NUDT17P0C025 328 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MAN1A1P33908 653 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FNTAP49354 379 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 EFNA5P52803 228 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GUCY2DQ02846 1103 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PPIL2Q13356 520 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 IRF5Q13568 498 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MTMR3Q13615 1198 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SURF1Q15526 300 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGAP44Q17R89 818 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 IER5Q5VY09 327 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 DUPD1Q68J44 220 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ERO1BQ86YB8 467 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 UBL4BQ8N7F7 174 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ASAP3Q8TDY4 903 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SLC7A3Q8WY07 619 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF516Q92618 1163 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ALG3Q92685 438 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 KAT5Q92993 513 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC102AQ96A19 550 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SAAL1Q96ER3 474 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PSMB7Q99436 277 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FAM204AQ9H8W3 233 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NRBP2Q9NSY0 501 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NFS1Q9Y697 457 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PODXLO00592 558 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FSCN2O14926 492 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CYP26A1O43174 497 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 HSF2BPO75031 334 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 VNN1O95497 513 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FGGP02679 453 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CLTAP09496 248 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PTGIRP43119 386 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LIG4P49917 911 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SLC7A5Q01650 507 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MCL1Q07820 350 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 STRN3Q13033 797 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CUL2Q13617 745 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CAPSQ13938 189 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FAM187BQ17R55 369 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TREML2Q5T2D2 321 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CFAP58Q5T655 872 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MON1BQ7L1V2 547 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.99□□□□□ -1.29
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