RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SFR1	Q86XK3	245 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DDX12P	Q92771	950 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	STAM	Q92783	540 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DHX58	Q96C10	678 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		16.2	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	VWA8	A3KMH1	1905 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CUTA	O60888	179 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	EPCAM	P16422	314 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GJD3	Q8N144	294 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	FAM212A	Q96EL1	285 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP45	Q9UL16	551 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TBX20	Q9UMR3	447 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	16.19	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087X0B3	334 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MYMK	A6NI61	221 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KIF4A	O95239	1232 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	COASY	Q13057	564 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KCNC3	Q14003	757 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	USP41	Q3LFD5	358 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CES5A	Q6NT32	575 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZPBP2	Q6X784	338 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MYO10	Q9HD67	2058 aa		16.18	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	B3GAT3	O94766	335 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GCNT3	O95395	438 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ADH1A	P07327	375 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PROZ	P22891	400 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CLCNKB	P51801	687 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF131	P52739	623 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG1	Q07617	926 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SNX27	Q96L92	541 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	WEE2	P0C1S8	567 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CXCL8	P10145	99 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	GAP43	P17677	238 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ABCD1	P33897	745 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MCL1	Q07820	350 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KANK3	Q6NY19	840 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PALB2	Q86YC2	1186 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PANK4	Q9NVE7	773 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CDH22	Q9UJ99	828 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	IRAK3	Q9Y616	596 aa		16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880		I3L4J1	428 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ABLIM1	O14639	778 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TEX28	O15482	410 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA31D3	P0C874	917 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SCP2	P22307	547 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF9	P41273	254 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DSG1	Q02413	1049 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZP2	Q05996	745 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		16.15	■□□□□ 0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		16.15	■□□□□ 0.18

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