RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 LSP1P33241 339 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 NPTX2P47972 431 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PEX5P50542 639 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 APLP1P51693 650 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PEX3P56589 373 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R2AP63151 447 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 LMNB2Q03252 620 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PPP3CAQ08209 521 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PRKG1Q13976 671 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 COG2Q14746 738 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PLCB4Q15147 1175 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ODF2Q5BJF6 829 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 XKR3Q5GH77 459 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 LRRC19Q9H756 370 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 EFCC1Q9HA90 598 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 GRIN2DO15399 1336 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 DENND3A2RUS2 1198 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 GMNCA6NCL1 334 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 VWA5AO00534 786 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 NFIBO00712 420 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 FSCN2O14926 492 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 SLC16A4O15374 487 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TTI1O43156 1089 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 EXTL3O43909 919 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 AGTP01019 485 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PIGRP01833 764 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 NR3C2P08235 984 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 RARGP13631 454 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 CYP11B1P15538 503 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ITIH2P19823 946 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ICAM3P32942 547 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 GCLMP48507 274 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 DNA2P51530 1060 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PMS2P54278 862 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 BACE1P56817 501 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 HUNKP57058 714 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 UBXN2AP68543 259 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 CENPCQ03188 943 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 STRN3Q13033 797 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 GRM1Q13255 1194 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 VGLL4Q14135 290 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 SURF1Q15526 300 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PTGISQ16647 500 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 LIN9Q5TKA1 542 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 JAMLQ86YT9 394 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 RDH13Q8NBN7 331 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 DNERQ8NFT8 737 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 CD101Q93033 1021 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 CEP170P1Q96L14 293 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 WHRNQ9P202 907 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 COL20A1Q9P218 1284 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 ESYT3A0FGR9 886 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ACTB-208ENST00000464611 SPOPO43791 374 aa9.11□□□□□ -0.95
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