RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	B3GAT3	O94766	335 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	DDHD2	O94830	711 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	UROD	P06132	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CASP1	P29466	404 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SLC11A1	P49279	550 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ACOT2	P49753	483 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	STIM1	Q13586	685 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CD302	Q8IX05	232 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	HLA-C	Q95604	372 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	HPSE	Q9Y251	543 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	UBE4B	O95155	1302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335		A0A0B4J269	797 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	C2CD2L	O14523	706 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	IL18RAP	O95256	599 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	PIGR	P01833	764 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	EDN1	P05305	212 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CXCL8	P10145	99 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	GART	P22102	1010 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	PROZ	P22891	400 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	NDUFV1	P49821	464 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	UBE2H	P62256	183 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CEP120	Q8N960	986 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	COG5	Q9UP83	839 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74	1e-6	■■■■■ 180.6
PKP4-208	ENST00000462335	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	INPPL1	O15357	1258 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	EXTL3	O43909	919 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SLC34A2	O95436	690 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KLRC2	P26717	231 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	NRIP1	P48552	1158 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CYP2J2	P51589	502 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CASP5	P51878	434 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CREM	Q03060	361 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SURF1	Q15526	300 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	KCNN1	Q92952	543 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	SNX27	Q96L92	541 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PKP4-208	ENST00000462335	DPP7	Q9UHL4	492 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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